生殖器疱疹少数患者，以前从未产生过单纯疱疹病毒传染。患者可感觉全身不适，发发热、头痛、肌肉酸痛等。外阴部出现成群的水疱，破溃后产生腐败溃疡，炎症较为明显，红肿，自觉疼痛，大腿根部的腹股沟淋巴结亦可肿大，压之疼痛。皮疹一般继续1-2周，光阴较长。
男性多发生于龟头、冠状沟、尿道口、阴茎体及阴囊。女性好发于外阴、阴道及宫颈。两性均可见于肛周、大腿及臀部。皮损形态及演变：患处先有烧灼感，随即出现多个群集的红色斑丘疹，并迅速变成小水疱。疱液起初清亮，以后渐变为脓性。水疱易破溃，形成糜烂或浅溃疡，伴明显疼痛。之后结痂而愈，病程约2～4周。
久治不愈原因：夫妻间的交叉感染：夫妻两人中只要有一个被生殖器疱疹侵袭，那么另一个也很快被传染。如果仅仅只是一方治疗，另一方还是会把病菌带给对方，导致生殖器疱疹永远无法根除，这在临床上被称为交叉感染。所以，在对生殖器疱疹等性病进行治疗时，一定要遵守夫妻同治的原则。
得了生殖器疱疹，千万不要存在侥幸心理，以为随便擦点抗病毒药膏或喝点什么 药就好了，这是大错特错。生殖器疱疹病毒（HSV）是深入骶神经节中，如果只是单存的在意患病部位的症状，你可就会陷入疱疹复发陷阱，因为根治疱疹的根源在于清除细胞核和神经节内的HSV病毒，如果只除症状，不除体内的病毒，复发只是时间的的问题。